Las Bombas Submarinas (Water Bomb en las versiones inglesas) son unos objetos de The Legend of Zelda: Twilight Princess. Ésta bomba conserva todas las cualidades de las Bombas normales, solo con la capacidad de explotar bajo el agua. Tienen el aspecto de un pez (semejante a una piraña) con una esfera negra en su boca.
Las Bombas Submarinas son necesarias para pasar el Santuario del Lago. Se les pueden comprar a Don Mechas en la Villa Kakariko, en la Tienda de Bombas, a partir del momento en el que Don Mechas envíe una carta a Link para comunicárselo. Se usan para destrozar rocas bajo el agua que revelan accesos secretos o sueltan Rupias. También pueden encontrarse en otras tiendas o en algunos Cofres.
Las Bombas Submarinas también aparecen como enemigos, denominados Peces Bomba. Tienen el mismo aspecto que las Bombas Submarinas normales, y se convierten en Bombas Submarinas al ser golpeados con la Espada. Aparecen en zonas acuáticas del Santuario del Lago y en la batalla contra Octópulo.